GM12878 細(xì)胞 是由美國(guó) Coriell 細(xì)胞庫(kù)提供的 EBV 轉(zhuǎn)化的人 B 淋巴細(xì)胞系,屬于淋巴母細(xì)胞樣細(xì)胞(lymphoblastoid cell line,LCL)。它來(lái)源于一位健康女性的外周血 B 淋巴細(xì)胞,經(jīng)過(guò) EB 病毒感染后獲得永生化能力。由于其 遺傳背景清晰、來(lái)源穩(wěn)定、可長(zhǎng)期傳代,GM12878 被廣泛用作標(biāo)準(zhǔn)的人類 B 細(xì)胞模型。尤其在 ENCODE(人類基因組功能元素計(jì)劃) 中,GM12878 是最常用的參考細(xì)胞系之一,被用于研究 染色質(zhì)開放區(qū)域、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、表觀修飾、RNA 表達(dá)譜 等。
基因組與表觀遺傳學(xué)研究
GM12878 是 ENCODE 計(jì)劃的核心細(xì)胞系,被大量用于 ChIP-seq、ATAC-seq、Hi-C、RNA-seq 等多組學(xué)研究。
免疫學(xué)與淋巴細(xì)胞功能研究
作為人 B 淋巴細(xì)胞模型,適用于 BCR 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、抗體產(chǎn)生機(jī)制、EBV 感染效應(yīng) 等研究。
癌癥與病毒學(xué)研究
雖為非腫瘤細(xì)胞,但由于 EBV 轉(zhuǎn)化,GM12878 在研究 EB 病毒致癌機(jī)制、淋巴瘤發(fā)生 中也具有參考意義。
藥物篩選與毒理學(xué)研究
作為穩(wěn)定的 B 細(xì)胞模型,用于 免疫調(diào)節(jié)藥物、抗病毒藥物 的檢測(cè)與作用機(jī)制研究。
對(duì)比細(xì)胞模型
常與 腫瘤性 B 細(xì)胞系(如 Raji、Daudi、U2932) 對(duì)比,用于研究腫瘤化與正常 EBV 轉(zhuǎn)化的差異。
免疫表型檢測(cè)
流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè) CD19、CD20、CD22,驗(yàn)證典型 B 細(xì)胞特征。
表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)
ChIP-seq、Hi-C、ATAC-seq,用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與調(diào)控研究。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
RNA-seq、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析,描繪 GM12878 的轉(zhuǎn)錄特征。
EBV 效應(yīng)研究
分析 EB 病毒轉(zhuǎn)化對(duì) B 細(xì)胞周期、凋亡、免疫逃逸 的影響。
信號(hào)通路研究
可用于檢測(cè) NF-κB、MAPK、PI3K/Akt 等淋巴細(xì)胞活化相關(guān)信號(hào)。
ENCODE 參考標(biāo)準(zhǔn):是人類基因組學(xué)研究最常用的參考細(xì)胞系之一。
穩(wěn)定可靠:遺傳背景明確,來(lái)源于健康供體,適合長(zhǎng)期實(shí)驗(yàn)。
多組學(xué)研究?jī)r(jià)值:可進(jìn)行 基因組學(xué)、表觀遺傳學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、三維基因組學(xué) 全面研究。
對(duì)比性強(qiáng):常與腫瘤性 B 細(xì)胞比較,用于探索 正常 EBV 轉(zhuǎn)化與惡性轉(zhuǎn)化的差異。
免疫學(xué)應(yīng)用:作為 B 細(xì)胞代表,可研究 抗體分泌、BCR 信號(hào)、抗原呈遞功能。
GM12878 細(xì)胞 作為人類 B 淋巴細(xì)胞的 EBV 轉(zhuǎn)化模型,不僅在 免疫學(xué)、病毒學(xué) 研究中具有重要意義,更因其在 ENCODE 等大規(guī)模基因組學(xué)計(jì)劃 中的應(yīng)用,而成為全球最常用的參考細(xì)胞系之一。未來(lái),隨著 單細(xì)胞組學(xué)、空間組學(xué) 的發(fā)展,GM12878 將繼續(xù)作為標(biāo)準(zhǔn)模型,用于 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、表觀修飾與轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制 的深入解析,并在 免疫相關(guān)疾病研究與新型藥物開發(fā) 中提供寶貴的實(shí)驗(yàn)支持。
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