2231670-91-8
中文名稱
磺酸基CY3.5活性酯
英文名稱
sulfo-Cyanine3.5 NHS ester
CAS
2231670-91-8
分子式
C42H40N3O16S4(-3)
分子量
971.03
MOL 文件
2231670-91-8.mol
2231670-91-8 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
水溶CY3.5 NHS磺酸基CY3.5活性酯
磺化CY3.5-NHS
磺化CY3.5-NHS 活化酯
水溶性CY3.5-NHS ESTER
英文別名
Sulfo cy3.5 NHS estersulfo-Cyanine3.5 NHS ester
所屬類別
生物化工：生化試劑物理化學性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深紫色固體
ex/em : 584/604 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 139000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.11
ex/em : 584/604 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 139000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.11
溶解度易溶于甲醇，DMF等有機溶劑，極易溶于水
外觀Dark purple solid
ε(消光系數(shù))139000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.11
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)584/604 nm (PBS buffer)
常見問題列表
熒光標記染料
磺化Cy3.5 (sulfo Cyanine 3.5; sulfo Cy3.5) 是一種發(fā)紅色熒光的花青素類熒光染料。磺化Cy3.5是磺化修飾過的Cy3.5，水溶性好，它在顯影時可以用561nm或者594nm的激光束激發(fā)然后用 Texas Red? 或相似的濾片觀察，所以也是一種非常常用的標記染料。磺化Cy3.5-NHS可以用來標記蛋白，抗體，多肽,核酸分子等。由于強水溶性加帶電荷，磺化花青素標記的生物分子更穩(wěn)定，不易產(chǎn)生疏水性聚集。NHS活化酯 （N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物標記反應中最常用的活化基團。它活化Cy3.5分子中的羧基，讓它可以和目標生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反應生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把磺化Cy3.5分子標記到生物大分子上。由于游離胺基是蛋白，抗體，多肽表面的常見官能團（來自于賴胺酸側(cè)鏈），磺化Cy3.5-NHS可以和它們直接反應。核酸分子中天然不帶游離胺基，只有胺基修飾過的RNA或者DNA才可以和磺化Cy3.5-NHS反應。
磺化Cy3.5-NHS活化酯的水溶性非常好，所以可以在水相的標記反應體系中直接使用，不需要有機溶劑助溶，特別適合標記蛋白等對有機溶劑敏感的生物分子。另外磺化Cy3.5水溶性極好，并且染料分子本身帶電荷，標記到蛋白表面后不會引發(fā)疏水性蛋白聚集，提高熒光標記產(chǎn)物的穩(wěn)定性?；腔疌y3.5-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有機溶劑，標記反應也可以在純有機溶劑中進行。如需脂溶性Cy3.5染料，可選擇普通花青素（cyanine），即Cy3.5-NHS活化酯。
磺化Cy3.5-NHS標記后的產(chǎn)物Ex/Em是591nm/604nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Texas Red?，Alexa Fluor 594, BODIPY? TR, DyLight 594等。
注意事項
- NHS活化酯基團對濕度比較敏感，務必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20分鐘。
- 使用不含氨基的緩沖體系。比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會和Cy3.5上的伯胺競爭。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應。
- 標記反應不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂白(photobleaching)。