2055138-89-9
中文名稱
水溶cy5.5-N3
英文名稱
diSulfo-Cy5 azide
CAS
2055138-89-9
分子式
C33H43N6NaO7S2
分子量
722.85
MOL 文件
2055138-89-9.mol
更新日期
2025/07/30 15:03:52
2055138-89-9 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
磺化CY3-疊氮水溶CY3-N3
水溶CY5.5-N3
二磺酸-CY3-疊氮
三磺酸基CY5.5疊氮
三磺酸-CY5.5-疊氮
二磺酸基-CY3疊氮(甲基)
水溶性DISULFO-CY3 AZIDE/N3/疊氮(METHYL)
英文別名
Sulfo Cy5.5 N3diSulfo-Cy5 azide
diSulfo-Cy3 azide/N3
triSulfo-Cy5.5 azide
所屬類別
化學(xué)試劑：有機(jī)試劑物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 紅色粉末
ex/em : 550/566 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 162000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.1
ex/em : 550/566 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 162000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.1
溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM
外觀Red powder
ε(消光系數(shù))162000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.1
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)550/566 nm (PBS buffer)
常見(jiàn)問(wèn)題列表
概述
水溶cy5.5-N3 是一種水溶性的疊氮青色素染料和熒光探針 (Ex/Em=548/563 nm)。Sulfo-cyanine3 azide sodium 可參與融合三環(huán)雜環(huán)的合成，制備免疫刺激劑。它含有 Azide 基團(tuán)，可以和含有 Alkyne 基團(tuán)的分子發(fā)生銅催化的疊氮-炔環(huán)加成反應(yīng)（CuAAc)。它還可以和含有 DBCO 或 BCN 基團(tuán)的分子發(fā)生環(huán)張力促進(jìn)的炔-疊氮環(huán)加成反應(yīng) (SPAAC)。熒光標(biāo)記染料
磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光譜性質(zhì)和Cy3類似，在熒光顯微鏡下發(fā)橘黃色熒光。它的熒光很亮，并且對(duì)pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激發(fā)然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用。標(biāo)記后，樣品背景熒光一般認(rèn)為比TAMRA等系列的染料低。磺化Cy3可以用來(lái)標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，核酸等各種生物分子。磺化Cy3水溶性非常好，可在水相標(biāo)記反應(yīng)體系中直接使用，不需要有機(jī)溶劑助溶，特別適合標(biāo)記對(duì)有機(jī)溶劑敏感的生物分子。另外由于強(qiáng)水溶性加染料分子本身帶電荷，磺化Cy3標(biāo)記到生物分子表面后不會(huì)引發(fā)疏水性聚集，提高熒光標(biāo)記產(chǎn)物的穩(wěn)定性。
疊氮(azide)是常用生物標(biāo)記基團(tuán)。通過(guò)點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)(click chemistry)，疊氮可以和一系列炔烴(alkyne)或環(huán)炔烴(strained alkyne)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)效率很高，可在水相中(也可有機(jī)相)快速定量完成(幾乎100%產(chǎn)率)，即使在低濃度(μM)和低溫(4oC)下也可完成。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)技術(shù)發(fā)展很成熟，各種相關(guān)試劑商業(yè)可得，各種生物標(biāo)記應(yīng)用廣泛。
磺化Cy3標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似熒光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY? TMR-X等。
注意事項(xiàng)
- 磺化Cy3水溶性高，極性強(qiáng)，如需脂溶性標(biāo)記染料，請(qǐng)選擇普通Cy3-疊氮。
- 疊氮化合物可被強(qiáng)還原劑(如DTT)還原破壞，使用時(shí)務(wù)必去除還原劑。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長(zhǎng)時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊(photobleaching)。