2247688-56-6
中文名稱
Cyanine3-氨基
英文名稱
Cyanine3 amine
CAS
2247688-56-6
分子式
C36H52Cl2N4O
分子量
627.74
MOL 文件
2247688-56-6.mol
更新日期
2025/07/26 16:17:09
2247688-56-6 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
CY3-氨基花青素CY3氨基
CYANINE3-氨基
1-[6-[(6-氨基己基)氨基]-6-氧羰基]-2-[3-(1,3-二氫-1,3,3-三甲基-2H-吲哚-2-亞基)-1-丙烯-1-基]-3,3-二甲基-3H-吲哚氯化銨鹽酸鹽
英文別名
NH2-CY3cy3-NH2
Cyanine3 amine
Cyanine3-amine,Cyanine3-NH2
所屬類別
生物化工：生化試劑物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 紅色固體
ex/em : 554/566 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 150000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.31
ex/em : 554/566 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 150000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.31
溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM
外觀Red solid
ε(消光系數(shù))150000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.31
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)554/566 nm (PBS buffer)
常見(jiàn)問(wèn)題列表
概述
Cyanine3-氨基 是 Cyanine3 amine 的類似物，是一種有效的綠色熒光染料。Cyanine3 amine hydrochloride 具有伯胺基團(tuán)，并與活性基團(tuán)如 NHS 酯、羧基(在碳二亞胺活化后)和環(huán)氧化物共價(jià)偶聯(lián)。(λex=555 nm，λem=570 nm)。熒光標(biāo)記染料
Cy3 (Cyanine 3) 是一種發(fā)橘黃色熒光的花青素?zé)晒馊玖?。它的熒光很亮，并且?duì)pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激發(fā)然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用。標(biāo)記后，Cy3的背景熒光一般認(rèn)為比TAMRA等TRITC系列的染料低。 Cy3可以用來(lái)標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等。伯胺基(primary amine)是生物標(biāo)記反應(yīng)中常用的基團(tuán)。蛋白表面賴氨酸側(cè)鏈(residue)官能團(tuán)就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),異氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基團(tuán)反應(yīng)生成穩(wěn)定鏈接，從而把Cy3分子連接到目標(biāo)分子上。
Cy3-伯胺的水溶性較低，所以在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)需要使用有機(jī)共溶劑，常用有機(jī)溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標(biāo)記的分子對(duì)有機(jī)溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy3-伯胺。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致，因此大部分應(yīng)用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機(jī)共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強(qiáng)標(biāo)記效率。
Cy3-伯胺標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似熒光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY? TMR-X等。
注意事項(xiàng)
- Cy3-伯胺水溶性較低，標(biāo)記反應(yīng)可在有機(jī)溶劑中進(jìn)行或者含有機(jī)助溶劑的水相中進(jìn)行。
- 標(biāo)記時(shí)使用不含氨基的緩沖體系，比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會(huì)和Cy3上的伯胺競(jìng)爭(zhēng)。高濃度咪唑(imidazole)也會(huì)影響反應(yīng)。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長(zhǎng)時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊(photobleaching)。